应急指挥的管理与安全保障系统主要实现信息在采集、传递、存储、处理以及应用等过程中的安全。应急指挥的管理与安全保障系统，除了具有人员管理/安全法规等安全管理措施以外，还必须利用安全技术从分层保护、分域保护和分级保护等不同维度为应急指挥系统提供相应的安全功能，主要的安全功能如下所述。

　　1.应急指挥场所的物理安全

　　应急指挥场所的物理安全的物理场所，如固定指挥中心大厅、应急指挥车等;划分的功能区域，区域之间设置物理隔离装置，并设置不同等级的出入权限等。

　　2.通信保密

　　对于涉密信息，通信时应按照有关规定配备与涉密信息密级相符的加密设备，实现信息的加密通信。同时，通信加密设备应符合相关通信系统通信接口、通信协议处理速率等特性，满足实际使用的处理延迟、服务质量/可靠性等方面的要求。

　　3网络和系统安全

　　网络和系统安全包括广域/区域以及指挥中心局域等通信网络安全以及系统安全等。

　　4应用系统安全

　　应用系统安全包括用户身份管理/身份鉴别/授权与访问控制/责任认定等。